Зелений щит з верхівкою у вигляді фортечної стіни увінчаний стрічкою кольорів Державного Прапора України. На щиті зображено три колоски та шестерню. Лазурова база відділена срібною стрічкою з написом "Кілійський район".

Затверджений 8 грудня 1998р. рiшенням сесії районної ради № 45-XXIII-IV

Прямокутне полотнище з співвідношенням сторін 2:3 складається з трьох горизонтальних смуг: синьої, жовтої та синьої (2:1:1). Верхня і середня розділені зубчасто, а середня і нижня хвилясто. На верхній смузі з боків два жовті якорі, між якими жовтий колосок з двома листками.

Затверджений 22 квітня 2003р. рiшенням сесії районної ради № 76-XXIV-VI.